新(xīn)华社深圳10月17日電(diàn)(记者陈宇轩 毛思倩)记者17日从中國(guó)农业科(kē)學(xué)院深圳农业基因组研究所了解到,科(kē)研人员成功绘制了基于一万余份水稻样本的群體(tǐ)变异图谱,这意味着水稻育种从此有(yǒu)了万份级样本的“数字地图”,為(wèi)进一步研究水稻基因的自然变异尤其是稀有(yǒu)变异提供了强有(yǒu)力的工具。
水稻是全球最重要的粮食作物(wù)之一,其基因组的自然变异是基因改良和现代育种的重要遗传基础。因此,要提升水稻育种水平,就必须在大规模的水稻群體(tǐ)中鉴定出自然变异,并进一步挖掘其中的稀有(yǒu)变异及其潜在应用(yòng)。
研究负责人、中國(guó)农业科(kē)學(xué)院深圳农业基因组研究所研究员商(shāng)连光表示,科(kē)研人员以水稻超级泛基因组為(wèi)依据,对10548份水稻样本进行了自然变异分(fēn)类,构建了水稻超大规模的群體(tǐ)基因组变异数据集,这就像一张水稻研究的“数字地图”,為(wèi)育种提供了清晰的指引。
借助“数字地图”的帮助,科(kē)研人员在水稻育种方面取得了新(xīn)的突破:一方面纠正了部分(fēn)水稻籼粳分(fēn)类上的错误;另一方面广泛分(fēn)析了重要功能(néng)基因在不同亚群中的群體(tǐ)频率,鉴定了其中的优异自然变异。
以此為(wèi)基础,科(kē)研人员还建立了面向全球用(yòng)户的在線(xiàn)数据库平台,為(wèi)水稻研究提供了单倍型整合分(fēn)析、变异图谱分(fēn)析、系统发育树分(fēn)析等科(kē)研服務(wù),进一步提升了我國(guó)在全球水稻研究领域的學(xué)术地位。
该研究由中國(guó)农业科(kē)學(xué)院深圳农业基因组研究所、崖州湾实验室、中國(guó)水稻研究所、河南大學(xué)等单位共同完成。相关研究成果近日发表于國(guó)际权威期刊《核酸研究》。